История села Зеленец берёт начало с IX века, с небольшого поселка по правому берегу Вычегды площадью в 3 тысячи кв. метров. Официальная дата возникновения села датируется с 1586 года, что отмечено в писцовой книге. В 2006 году состоялся 420-летний юбилей села Зеленец. Согласно реформе Екатерины II в 1775 году село Зеленец стал центром Богоявленской волости Усть-Сысолъского уезда, и было введено местное самоуправление. С 1 января 2006 года административная территория именуется сельским поселением «Зеленец», являющимся вторым по величине населенным пунктом в МО «Сыктывдинский» со своей cтрyктуpoй органов местного самоуправления.
Дo 1917 года в Богоявленскую волость входили поселения: погост Богоявленский, деревни Койтыбожская, Чукачойская, Парчегская.
Согласно Федеральному Закону от 06.10.2003 г № 131-ФЗ «Об общих принципах организации местного самоуправления в РФ» село Зеленец получило статус муниципального образования сельского поселения «Зеленец». Образовано с 1 января 2006 года. На административной территории сельского поселения «Зеленец» расположены 4 населённых пункта: д. Койтыбож, с. Зеленец, д. Чукачой, д. Парчег.
Общая площадь сельского поселения «Зеленец» 583 гектара земли, протяжённость административной территории составляет 12 километров. За администрацией сельского поселения закреплены земли сельхозназначения в количестве 2021 гектар земли.
